本ガイドラインは手洗い・病院環境管理のためのガイドライン（1985）の一部を改訂したもので、環境感染管理における以下の項目などについて勧告しています。

空調管理：
一般空調、HEPA空調、換気回数、改修工事時のアスペルギルス対策、重度免疫不全患者の陽圧病室、空気感染予防のための陰圧病室、手術室など

水管理：
水まわり衛生、温水・冷水の温度管理、改修工事時の注意、塩素消毒、クーリングタワー管理、レジオネラ対策、透析用水、製氷機、水治療浴槽など

環境整備：
医療機器・病室環境の清掃・消毒、植物、ペストコントロールなど

環境調査：
空気・水・環境表面の微生物検査

洗濯・寝具：
洗濯室、洗濯物の扱い、洗濯条件（71℃25分）、マットレス・枕など

医療施設内の動物：
盲導犬、治療用動物など

医療廃棄物：
医療廃棄物の分類、扱い、輸送、保管、処理、廃棄

環境清掃・消毒については以下のような勧告をしています。

• 環境表面は定期的に清掃し、汚物は直ちに清掃すること。カテゴリーII
• 汚れの内容が不明な場合、ないし多剤耐性菌による汚染の恐れがある場合には、消毒薬入り洗浄剤（訳注：日本では塩化ベンザルコニウム、両性界面活性剤などに相当）で清掃すること。カテゴリーII
• ドアノブなど高頻度に接触する表面は、床などほとんど接触しない表面よりも頻繁に清掃・消毒すること。カテゴリーII
• 血液・体液は拭き取り、500-615ppm次亜塩素酸ナトリウムで消毒すること。カテゴリーIB
• 血液・体液を拭き取る前に消毒薬を適用する場合は、5,000-6,150ppm次亜塩素酸ナトリウムを使用すること。カテゴリーIB