免疫不全の専門家グループが最近発表した勧告は、一部の免疫不全患者はクリプトスポリジウム症発症の危険が特に高く、T細胞機能が不全の患者は、水道水であれボトル入り飲料水であれ、煮沸してから冷やて飲むべきであり、氷も同様の水によって作るべきであるとした。これに該当する患者には、免疫抑制下のHIV患者、重度複合免疫不全(SCID)の小児などが含まれる。