2005年日本において、30歳の偽膜性大腸炎女性患者の便から、Clostridium difficile (North American pulsed field gel electrophoresis type 1, PCR ribotype 027, toxinotype III)が分離された。これは日本における最初のClostridium difficile 027の分離である。日本においてこれまでに発生しているClostridium difficile集団感染は、Clostridium difficile 027によるものではない。Clostridium difficile 027は北米と欧州で問題となっているが、今回の分離菌が日本国外から持ち込まれたもであるかどうかは不明である。